Genetická mapa: sledujte živě šíření eboly nebo ziky

Přestože medicína jde neustále kupředu, stále reagujeme pomalu, když nás zaskočí nějaká globální epidemie. Loni to byla například epidemie eboly či šíření viru zika. Aby lidé, úřady a další instituce dokázaly příště lépe reagovat, vytvořila dvojice vědců mapu, která sleduje v reálném čase šíření nemocí a zachycuje jejich mutace. Za projekt NextStrain získali mladí vědci v úterý ocenění Open Science Prize.

V době globalizace, otevřených hranic a letecké přepravy se nemoci šíří do celé světa rychleji, než kdy dřív. Přestože epidemie eboly zabíjela především v Africe, někteří nemocní se dostali i do zbytku světa, což vyvolalo paniku na letištích a dalších veřejných prostorech. Nemoc zabila více než 11 tisíc lidí. Virus zika se zase koncentroval v Jižní Americe, kvůli Olympijským hrám v Riu de Janeiru ale hrozila nákaza po celém světě. Virus má na svědomí tisíce postižených novorozeňat.

Richard Neher z Univerzity v Basileji a Trevor Bedford z výzkumného centra Fred Hutchinson Cancer Research Center v americkém městě Seattle se rozhodli epidemiím předejít, nebo je aspoň zmírnit, moderním nástrojem – pomocí internetové aplikace. Genetická mapa NextStrain důkladně sleduje mutace virů a jejich cestu po světě.

Na virech je totiž nebezpečné, jak se umí rychle adaptovat a mutovat. Například ebola se podle serveru Quartz zřejmě dostala z divokého zvířete na dvouleté batole, kde došlo k takové mutaci, která umožnila masové šíření mezi lidmi.

Neher a Bedford začali výzkum s virem chřipky, protože chřipka je podle nich nejdůkladněji prozkoumaná nemoc a veškerá data byla snadno dostupná. Genetické informace viru pak zaznamenávali ve svém projektu NextStrain. Po dvou letech pak začala vrcholit epidemie eboly. Terénní pracovníci tehdy sbírali genetické informace viru z různých oblastí, které pak výzkumníci začali ve svém projektu dávat do kontextu. Do výzkumu poté začlenili i virus zika.

Výzkumníci vidí budoucnost projektu v propojení s úřady a dalšími institucemi. Podle Bedforda například při šíření viru zika mohl projekt NextStrain včas varovat oblasti, kam nákaza míří, a úřady mohly lépe zareagovat. Jejich mapa totiž v reálném čase ukazuje postupné šíření nákazy a její mutaci. Výzkumníci však upozorňují, že nedokáží předpovědět, která epidemie a kdy se příště rozšíří.

Neher a Bedford chtějí nyní přilákat další vědce, kteří by se na projektu podíleli. S tím by chtěli rozšířit i portfolio onemocnění, které bude projekt sledovat. Ocenění Open Science Prize přineslo výzkumníkům nejen prestiž a uznání, ale i peníze na další výzkum na globální úrovni.

Čtěte také: Díky Čechům zmizí ústavy pro duševně nemocné v Moldavsku